- 
Gobiodon acicularis Harold & Winterbottom, 1995
 
- 
Gobiodon albofasciatus Sawada & Arai, 1972
 
- 
Gobiodon atrangulatus Garman, 1903
 
- 
Gobiodon axillaris De Vis, 1884
 
- 
Gobiodon citrinus Dor, 1984
- Gobius citrinus Rìppell, 1838; (valid as)
- Pseudogobiodon citrinus Bleeker, 1874; (valid as)
 
 
 
- 
?Gobiodon flavidus De Vis, 1884
 
- 
?Gobiodon flavus Sauvage, 1880
 
- 
Gobiodon fulvus Herre, 1927
 
- 
?Gobiodon gnathus Tomiyama, 1934
 
- 
Gobiodon heterospilos Bleeker, 1856
 
- 
Gobiodon histrio Harold & Winterbottom, 1995
- Gobius histrio Valenciennes (ex Kuhl & van Hasselt), 1837; (valid as)
 
 
 
- 
?Gobiodon hypselopterus Bleeker, 1875
 
- 
?Gobiodon inornatus De Vis, 1884
 
- 
?Gobiodon lineatus De Vis, 1884
 
- 
Gobiodon micropus Gìnther, 1861
 
- 
Gobiodon multilineatus Wu, 1979
 
- 
Gobiodon oculolineatus Wu, 1979
 
- 
Gobiodon okinawae Sawada, Arai & Abe, 1972
 
- 
?Gobiodon punctatus Kossmann & R¤uber, 1877
 
- 
Gobiodon reticulatus Playfair, 1867
 
- 
Gobiodon rivulatus Dor, 1984
- Gobius rivulatus Rìppell, 1830; (valid as)
- Gobius coryphaenula Valenciennes, 1837; (synonym)
- Gobius quinquestrigatus Valenciennes, 1837; (synonym)
- Gobius ceramensis Bleeker, 1852; (synonym)
- Gobiodon erythrospilus Bleeker, 1875; (synonym)
- Gobiodon venustus Sauvage, 1880; (synonym)
- Gobiodon albolineatus Smith, 1959; (synonym)
- Gobiodon ceramensis Dor, 1984; (synonym)
- Gobiodon quinquestrigatus Dor, 1984; (synonym)
 
 
 
- 
?Gobiodon spilophthalmus Fowler, 1944
 
- 
Gobiodon unicolor Harold & Winterbottom, 1995
- Ellerya unicolor Castelnau, 1873; (valid as)
 
 
 
- 
?Gobiodon verticalis Alleyne & Macleay, 1877